SDF Merger 1.0 — для объединения нескольких файлов SDF в один документ

 

Бесплатное десктопное приложение для объединения нескольких файлов SDF (Structure-Data File) в один документ. Инструмент разработан для химиков и исследователей, работающих с молекулярными данными. Программа SDF Merger решает частую проблему в сфере хемоинформатики и вычислительной химии — необходимость объединения сотен или тысяч отдельных файлов молекулярных структур в один общий датасет. В процессах виртуального скрининга и молекулярного докинга (поиска потенциальных лекарств) ученые работают с огромными библиотеками лигандов. Часто библиотеки генерируются в виде множества разрозненных файлов формата .sdf. Объединение их вручную занимает много времени и приводит к ошибкам в структуре данных. SDF Merger автоматизирует этот шаг, убирая необходимость писать собственные скрипты на Python и снижая технический барьер для исследователей. Программа не просто склеивает файлы как текст, а работает с ними как с объектами данных, гарантированно сохраняя: 3D/2D Координаты атомов молекулы; Ассоциированные метаданные (название соединения, молекулярный вес, расчетные свойства, ID в базе данных и любые пользовательские теги); Разделители структур ($$$$), принятые в международном стандарте SDF формата.

Сайт: sourceforge.net/projects/sdf-merger/
Лицензия: бесплатно
Язык интерфейса: Английский
ОС: Windows 10 – 11
Скачать: SDF Merger 1.0

SDF Merger 1.0 (sourceforge)