DEBay 1.0.0 — для деконволюции данных количественной ПЦР (кПЦР) смешанных популяций клеток

 

Бесплатный вычислительный инструмент на базе Python, предназначенный для деконволюции данных количественной ПЦР (кПЦР) смешанных популяций клеток с целью оценки уровня экспрессии генов в конкретных типах клеток. В биологических экспериментах физическое разделение различных типов клеток из смешанного образца часто является сложной и трудоемкой задачей. Если пропорции различных типов клеток в образце можно измерить (например, с помощью проточной цитометрии), DEBay позволяет вычислить относительную экспрессию целевого гена для каждого конкретного типа клеток, используя математическое разделение (деконволюцию) общего сигнала кПЦР. Инструмент оценивает нормированный коэффициент экспрессии генов (NGEC), который математически соответствует нормированному кратному изменению (fold change) экспрессии генов, измеряемому в ходе кПЦР.

Сайт: sourceforge.net/projects/debay/
Лицензия: бесплатно
Язык интерфейса: Английский
ОС: Windows 7 – 11 x64
Скачать: DEBay 1.0.0 x64

DEBay 1.0.0 x64 (sourceforge)