CrystalCMP 128 — для автоматического сравнения упаковок молекул в кристаллических структурах

 

Бесплатное программное обеспечение, предназначенное для автоматического сравнения упаковок молекул в кристаллических структурах. Оно разработано для быстрой классификации сходства структур и выявления идентичных упаковок, что особенно полезно при работе с большими массивами данных. Программа использует два основных подхода — метод отпечатков пальцев (fingerprints) и метод RMSD (среднеквадратичное отклонение атомных позиций). Результаты сравнения представляются в виде матрицы сходства и дендрограммы (кластерного анализа). Также поддерживается отрисовка наложенных друг на друга кристаллических структур для визуальной оценки. В последних версиях реализованы алгоритмы автоматического выбора фрагментов молекул для наложения, что позволяет обрабатывать тысячи структур без участия пользователя. Поддерживает работу с форматами данных CSD и использует библиотеку OpenBabel для работы со строками SMILES.

Сайт: sourceforge.net/projects/crystalcmp/
Лицензия: бесплатно
Язык интерфейса: Английский
ОС: Windows 7 – 11
Скачать: CrystalCMP 128