sonraid.ru

Бесплатное программное обеспечение, предназначенное для автоматического измерения углов кончиков корней растения Arabidopsis thaliana. Программа используется в научных исследованиях для изучения гравитропизма (реакции корней на силу тяжести). Автоматизация заменяет ручные измерения, которые часто подвержены человеческим ошибкам и предвзятости. Ускоряет анализ микроскопических данных и изображений, полученных со сканеров. Измеряет углы изгиба корня в динамике (с течением времени). Читать далее

Бесплатное приложение для ОС Windows, предназначенное для комплексного анализа и визуализации мультиомных данных. Программа разработана на Java 11 и ориентирована на упрощение работы в сфере биоинформатики. Мультиомика: транскриптомика, геномика, протеомика, метаболомика и анализ данных единичных клеток (single cell). Биоинформатика: анализ последовательностей и микробиологические исследования. Читать далее

Бесплатный интерактивный браузер генома и редактор аннотаций. Программа написана на языке Java и предназначена для ученых и исследователей в области биоинформатики. Визуализация данных: поддержка эталонных последовательностей, графов, коротких прочтений (NGS) и множественных выравниваний. Редактирование: встроенный редактор аннотаций. Универсальность: работает с большинством основных форматов данных и позволяет загружать файлы как из локального хранилища, так и из интернета. Безопасность: поддержка аутентификации и шифрования данных. Читать далее

Бесплатная программная среда для анализа данных секвенирования ДНК с высокой пропускной способностью. Она поддерживает работу как с короткими, так и с длинными прочтениями. Инструмент для сборки генома de-novo. Выравнивание сырых прочтений на референсный геном, а также поиск SNP, CNV и структурных вариаций. Функциональная аннотация, фильтрация, сравнение, объединение и импутация файлов формата VCF. Добавлены функции выравнивания геномов и аннотации транспозонов. Читать далее