Рубрика: Редакторы

Бесплатный вычислительный инструмент на базе Python, предназначенный для деконволюции данных количественной ПЦР (кПЦР) смешанных популяций клеток с целью оценки уровня экспрессии генов в конкретных типах клеток. В биологических экспериментах физическое разделение различных типов клеток из смешанного образца часто является сложной и трудоемкой задачей. Если пропорции различных типов клеток в образце можно измерить (например, с помощью проточной цитометрии), DEBay позволяет вычислить относительную экспрессию целевого гена для каждого конкретного типа клеток, используя математическое разделение (деконволюцию) общего сигнала кПЦР. Читать далее

Бесплатный узкоспециализированный научный инструмент для постобработки, трехмерной визуализации и комплексного анализа экспериментальных данных, полученных методами сканирующей туннельной микроскопии (STM) и сканирующей туннельной спектроскопии (STS). Программа решает проблему совместимости данных между исследовательскими лабораториями, так как напрямую работает с проприетарными файлами разного оборудования. Читать далее

Бесплатная научно-исследовательская программная среда, главная цель которой упростить проектирование, верификацию и валидацию сложных систем с помощью визуального блочно-иерархического моделирования. Пользователь создает систему из отдельных блоков. Блоки могут быть «симулируемыми» (содержать код логики) и «несимулируемыми» (описательными). На основе визуально спроектированных моделей CoSMoSim автоматически генерирует исполняемый программный код на Java, освобождая инженера от ручного программирования. Все спецификации моделей, структуры и результаты экспериментов сохраняются и систематизируются в СУБД (например, MS Access или PostgreSQL). Читать далее

Бесплатный язык программирования, он разработан специально для начинающих, чтобы помочь им освоить основы программирования в дружелюбной визуальной среде с помощью блок-схем. Поддерживаются типы переменных Integer (целое), Real (вещественное), String (строка) и Boolean (логическое) с возможностью задавать начальные значения. Выражения используют стандартный синтаксис, похожий на языки C/C++, что значительно упрощает будущий переход на «взрослые» текстовые языки. Читать далее

Бесплатный программный инструмент, написанный на языке Java и предназначенный для оцифровки данных с графиков, чертежей и диаграмм. Она позволяет переводить бумажные или растровые графические изображения в точные числовые массивы данных. Приложение поддерживает работу с растровыми изображениями в форматах .png, .gif, .bmp и других. Читать далее

Бесплатная программа для извлечения точных числовых данных из изображений графиков, диаграмм и карт. Инструмент активно применяется учеными, инженерами и студентами для восстановления данных из старых публикаций или PDF отчетов. Обрабатывает стандартные XY-графики (линейные, точечные), столбчатые диаграммы, гистограммы, а также полярные и тройные (тернарные) фазовые диаграммы. Читать далее

Бесплатная программа, созданная для манипулирования, модификации и анализа различных спектроскопических данных. Особое внимание в ней уделено работе со спектрами электронного парамагнитного резонанса (ЭПР/ESR). Поддерживает файлы спектрометров Bruker (ElexSys, EMX, ESP), текстовые форматы ASCII и импорт через буфер обмена. Коррекция базовой линии (полиномы, сплайны, смещение), фильтрация, обрезка спектров, дифференцирование и интегрирование. Прямое и обратное преобразование Фурье, преобразование Гильберта, нелинейная подгонка кривых (Curve Fitting) и глобальный анализ нескольких кривых одновременно. Архитектура позволяет создавать и подключать собственные плагины. Читать далее